Markus‘ Forschungsinteressen liegen in der Entwicklung und Anwendung von Algorithmen, Werkzeugen und Workflows zur Generierung von Wissen aus biologischen Daten. Er möchte die große Menge an öffentlich verfügbaren Daten und Software nutzen, um einige der Geheimnisse des Lebens zu entschlüsseln. Markus glaubt an Open Source, offene Daten, offene Wissenschaft und reproduzierbare Forschung.